关于LJ配置文件保存

之前我一直用整合包，最近想用盒子上的一些配置分享，但是担心之前LJ调试的一些参数没有了，需要重新调整，想请教各位彦祖，在盒子自动删除整合包所在文件夹时候，会连带着LJ也没有吗？